WEKO3
アイテム
Coarse-graining of perplexity for the spatial distribution of molecules
http://hdl.handle.net/10271/0002000468
http://hdl.handle.net/10271/000200046821f1532b-2bb5-4328-98fb-9ac8f1bbd9ef
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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論文本文 (3.4 MB)
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.png)
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| Item type | 共通アイテムタイプ / Common item types(1) | |||||||||
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| 公開日 | 2025-08-21 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | Coarse-graining of perplexity for the spatial distribution of molecules | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||
| その他のタイトル | ||||||||||
| その他のタイトル | 分子の空間分布に対するパープレキシティの粗視化 | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||||
| アクセス権 | ||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||
| 著者 |
Xu, Lili
× Xu, Lili
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| 著者情報 |
シュ, リリ
× シュ, リリ
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| 書誌情報 |
en : Physical review E 巻 109, 号 1, p. 014402, ページ数 5, 発行日 2024-01 |
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| 出版者 | ||||||||||
| 出版者 | American Physical Society | |||||||||
| 権利 | ||||||||||
| 権利情報 | Published by the American Physical Society under the terms of the Creative Commons Attribution 4.0 International license (CC BY). Further distribution of this work must maintain attribution to the author(s) and the published article's title, journal citation, and DOI. | |||||||||
| 抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||
| 内容記述 | Biological tissue consists of various molecules. Instead of focusing on a particular molecule, we consider the Shannon entropy which is calculated from the abundance of different molecules at each spot in the tissue. The spatial distribution of the Shannon entropy is of interest. In this paper, we first obtain the heat map of perplexity, whose logarithm is the entropy. To characterize the spatial variety of molecules, we propose a scalar k that is concerned with the coarse-graining of the perplexity heat map. To verify the usefulness of the number, experiments with mass spectrometry imaging were performed for mouse kidneys. We found that k has large values in the renal pelvis area, cortex area, veins, and arteries in the mouse kidney, whereas fractal dimensions fail to distinguish those regions. | |||||||||
| 学位名 | ||||||||||
| 学位名 | 博士（医学） | |||||||||
| 学位の区分 | ||||||||||
| 内容記述 | doctoral | |||||||||
| 学位の分野 | ||||||||||
| 内容記述 | 医学系研究科 | |||||||||
| 学位授与機関 | ||||||||||
| 学位授与機関名 | 浜松医科大学 | |||||||||
| 学位授与機関名 | Hamamatsu University School of Medicine | |||||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||||
| 学位授与年月日 | 2024-09-20 | |||||||||
| 学位授与番号 | ||||||||||
| 学位授与番号 | 甲第998号 | |||||||||
| PISSN | ||||||||||
| 収録物識別子 | 2470-0045 | |||||||||
| EISSN | ||||||||||
| 収録物識別子 | 2470-0053 | |||||||||
| PubMed番号 (PMID) | ||||||||||
| 関連識別子 | 38366427 | |||||||||
| 出版社DOI | ||||||||||
| 関連識別子 | https://doi.org/10.1103/PhysRevE.109.014402 | |||||||||
| 学位論文要旨/本文へのリンク | ||||||||||
| 関連識別子 | http://hdl.handle.net/10271/0002000251 | |||||||||
| 関連名称 | 学位論文要旨 | |||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||
