| Item type |
学術雑誌論文 / Journal Article(1) |
| 公開日 |
2013-08-27 |
| タイトル |
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タイトル |
連続体円筒モデルによる有機分子としてのDNAのポテンシアル計算 |
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言語 |
ja |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| キーワード |
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主題 |
DNA分子自由エネルギー |
| キーワード |
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主題 |
電荷分布 |
| キーワード |
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主題 |
ポテンシアル |
| キーワード |
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主題 |
静電力 |
| キーワード |
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主題 |
Debye-Huckel理論 |
| キーワード |
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主題 |
DNA free energy |
| キーワード |
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主題 |
Electrical charge |
| キーワード |
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主題 |
Electrical Force |
| キーワード |
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主題 |
Screening effects |
| キーワード |
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主題 |
Debye-Huckel theory |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
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資源タイプ |
journal article |
| その他のタイトル |
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その他のタイトル |
A Method for Computing the Potentials in a DNA by a Concentric Cylinder Model |
| 著者 |
平山, 博史
沖田, 善光
杉浦, 敏文
木村, 元彦
数井, 輝久
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| 書誌情報 |
電子情報通信学会技術研究報告. OME, 有機エレクトロニクス Technical report of IEICE. OME
巻 100,
号 556,
p. 37-44,
発行日 2001-01-11
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| 出版者 |
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出版者 |
電子情報通信学会 |
| 権利 |
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権利情報 |
電子情報通信学会 |
| 権利 |
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権利情報 |
本文データは学協会の許諾に基づきCiNiiから複製したものである |
| 抄録 |
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内容記述タイプ |
Abstract |
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内容記述 |
DNA分子を自由エネルギーの視点から解析する方法をBailey(1976)らの研究にもとずいて紹介し、DNAを構成するリン酸による負の電荷分布によるポテンシアルと静電力の三次元分布を計算した。DNA分子は円筒状とし、電荷(イオン)が存在しない内相とイオン同士が相互干渉しあう中間領域および外部電場を設定した。これらに対して、それぞれ、ラプラス方程式およびポアソン方程式を設定し2つの境界での連続性を境界条件として、Green関数を用いて、円筒座標系におけるポテンシアルを求めた。また円周方向に微分することで、静電力を算出し、それぞれの3次元分布をもとめた。ポテンシアルはDNAの円周方向で明確に変化した。静電力はそれより複雑な挙動をしめした。本研究を発展させることでDNA分子の自由エネルギーを計算することが可能である。 A method was introduced for computing the three dimensional distribution of the free energy and electro static force in a DNA molecules that has been proposed by Bailey(1976). A DNA molecule was modeled by a cylinder composed of three regions, inner region in which there is no ion, the intermediate region where the ions interact on the basis of screening effects of Debye-Huckel theory. These two regions were described by the Laplace equation. The outer region was described by the Poisson equation due to the surrounding ions atmosphere. The coefficients of the equations were determined by the continuity across the two boundaries of the three regions. The potentials and forces heavily depended on the circumferential angles. The present method, when it was improved, will be available for evaluating the free energy and potential of the DNA molecule. |
| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
09135685 |
| NII論文ID |
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関連タイプ |
isIdenticalTo |
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識別子タイプ |
NAID |
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関連識別子 |
110003301305 |
| 著者版フラグ |
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出版タイプ |
VoR |
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出版タイプResource |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
110003301305.pdf (653.0 kB)
